El centro tiene un función clave, dado que es el encargado de distribuir vacunas a cada uno de los servicios del Hospital Urquiza y a todo el departamento Uruguay, ya que todos las localidades que abarca el departamento están abastecidos de vacunas y material descartable por el nosocomio de nuestra ciudad .
Allí se controlan las vacunas, se hace el inventario para actualizar stock de vacunas y así poder determinar cuándo vencen y cuando se debe pedir el reabastecimiento. Los pedidos de vacunas y de material descartable se realizan a la ciudad de Paraná, donde se realizan hasta dos viajes semanales para proveer insumos y dosis. Es importante destacar que el Hospital Urquiza no posee un vacunatorio abierto al público y la aplicación de las vacunas es tarea de los respectivos centros de salud.